La raccolta numismatica del'Istituto Veneto è divisa in due sezioni: una prima riguarda le medaglie "premio d'industria", destinate cioè agli inventori, agli imprenditori, agli artigiani e ai coltivatori più intraprendenti del Veneto e delle regioni vicine. La loro distribuzione (per oltre 120 anni, sino al 1925) costituì uno dei compiti più importanti dell'ente. L'altra sezione invece raccoglie le medaglie legate alle vicende dell'Istituto, dalle commemorazioni, ai congressi, alle manifestazioni di costume.
 
L'inventario è pubblicato in Leonardo Mezzaroba, Le medaglie dell'Istituto Veneto di Scienze, Lettere ed Arti, «Atti dell'Istituto Veneto di Scienze, Lettere ed Arti», 168 (2009-2010), Classe di scienze morali, lettere ed arti, pp. 289-336, Venezia 2010.