L'Istituto promuove annualmente scuole internazionali di approfondimento, alle quali partecipano studiosi italiani e stranieri ammessi su concorso per titoli.
Scuole recentemente promosse:
-Scuola di Biofisica Pura e Applicata, in collaborazione con la Società Italiana di Biofisica Pura e Applicata;
-Seminario italo-francese sui problemi relativi alla salvaguardia del patrimonio artistico e archivistico, in collaborazione con l'Institut National du Patrimoine di Parigi;
-Spring School promossa in collaborazione con l'Unione Zoologica Italiana;
-Summer School on Biogeodynamics and Earth System Sciences (BESS), in collaborazione con la Duke University (U.S.A.), l'ESSC di Reading (U.K.), l'ISAC-CNR di Torino, il MIT (U.S.A.) e l'Università di Padova;
-Seminario Internazionale di Storia dell'Arte Veneta, in collaborazione con l'Ecole du Louvre;
-Ciclo di corsi di alta formazione su "Paesaggio: immagine e realtà", in collaborazione con la Fondazione Federico Zeri;
-Summer School on Evolutionary Developmental Biology conceptual and theoretical aspects of evolutionary developmental biology, in collaborazione con il Konrad Lorenz Institute for Evolution and Cognition Research di Vienna;
-Winter School on "Fundamentals and Methods for Impact Evaluation of Public Policies", in collaborazione con l'Istituto per la Ricerca Valutativa sulle Politiche Pubbliche (IRVAPP), del Centro Interuniversitario di Econometria (CIdE) e dell'Associazione Italiana di Econometria (SIdE);
-Seminari sulla comunicazione scientifica, in collaborazione con Observa e nell'ambito del progetto europeo IRIS (Interest for Recruitment in Science).

Inoltre vengono ospitati ormai da qualche anno i corsi estivi della Vanderbilt Law School e i corsi di Diritto comparato tenuto dalla Wake Forest University School of Law (North Carolina-Usa), organizzato in collaborazione con la Facoltà di Giurisprudenza dell'Università di Padova.